刘阳，理学博士

医学遗传系博士生导师，副研究员，新体制助理教授

联系方式

邮箱：liu.y@pku.edu.cn

实验室：中心实验楼808室

个人简介

博士毕业于北京大学，并于北京大学生命科学学院完成了博士后研究。在国际上首次解析了DNA复制的时空组织模式，提出了“复制叉成对偶联”的三维模型。以（共同）第一或通讯作者身份在 Science，Nature Genetics，PNAS 等国际高水平期刊发表研究论文10余篇，授权国家发明专利1项。主持国自然青年科学基金（B类）项目。

研究方向

DNA代谢、基因组稳定性与人类疾病

DNA复制是生命的基础，控制着遗传信息从亲代到子代的准确传递。复制紊乱将导致基因组不稳定性，而后者是癌症、男性不育、人类胚胎早期发育障碍等多种疾病的关键诱因。在哺乳动物细胞中，DNA复制发生于高度复杂的染色质环境中，其包含多样的表观修饰、多层有序的三维结构，并涉及转录、DNA损伤修复等关键生物学事件。因此，细胞必须精确协调DNA复制与染色质环境之间的相互作用，以维持基因组的完整性。然而，目前对于这一调控网络的理解仍不够深入，主要受限于研究手段的不足。鉴于此，本实验室将围绕DNA 复制过程中的基因组稳定性维持的分子机制及其在重大疾病发生发展中的作用这一关键科学问题，系统开展以下研究方向：

1. 科学问题导向的高通量测序新技术的开发及应用（专注于DNA复制、损伤修复等DNA代谢过程）；

2. 复杂染色质环境下，DNA代谢过程中基因组稳定性维持的分子机制及调控策略；

3. 研究DNA代谢及基因组稳定性与肿瘤、男性不育、胚胎发育缺陷之间的联系，并深入探究这些过程中的分子机制及遗传基础；

热忱欢迎有理想的优秀本科或硕士毕业生加入我们的团队。本课题组长期招聘具有生物信息学、分子生物学、遗传学、细胞生物学、生物化学等相关专业或有学科交叉背景的技术员、研究助理和博士后等人员。

近五年已发表论文(# 共同第一作者，* 共同通讯作者)

1. Liu, Y.#, Zhangding, Z.#, Liu, X.#, Gan, T., Ai, C., Wu, J., Liang, H., Chen, M., Guo, Y., Lu, R., Jiang, Y., Ji, X., Gao, N., Kong, D., Li, Q., Hu, J.* (2024) Frok coupling directs DNA replication elongation and termination. Science   383 , 1215-1222.

2. Wu, J.#, Liu, Y.#, Zhangding, Z.#, Liu, X.#, Ai, C., Gan, T., Liang H., Guo, Y., Chen, M., Liu, Y., Yin, J., Zhang, W., Hu, J.* (2023) Cohesin maintains replication timing to suppress DNA damage on cancer genes. Nat. Genet.   55 , 1347-1358.

3. Liu, Y.#, Ai, C.#, Gan, T.#, Wu, J., Jiang, Y., Liu, X., Lu, R., Gao, N., Li, Q., Ji, X., Hu, J.* (2021) Transcription shapes DNA replication initiation to preserve genome integrity. Genome Biol.   22 , 176.

4. Liu, Y.#, Wang, L.#, Xu, X., Yuan, Y., Zhang, B., Li, Z., Xie, Y., Yan, R., Zheng, Z., Ji, J., Murray, J., Carr, A., Kong, D.* (2021) The intra-S phase checkpoint directly regulates replication elongation to preserve the integrity of stalled replisomes. Proc Natl   Acad Sci U S A   118,  24.

5. Wu, J.#, Zou, Z.#, Liu, Y.#^,*, Liu, X., Zhangding, Z., Xu, M.*, Hu, J.* (2022) CRISPR/Cas9-induced structural variations expand in T lymphocytes in vivo. Nucleic Acids Res.   50,  19.

6. Wu, J.#, Liu, Y.#, Ou, L.#, Gan, T.#, Zhangding, Z., Yuan, S., Liu, X., Liu, M., Li, J., Yin, J., Xin, C., Tian, Y., Hu, J.* (2024) Transfer of mitochondrial DNA into the nuclear genome during induced DNA breaks. Nat. Commun . 15, 9438.

7. Yin, S.#, Zhang, M.#, Liu, Y.#, Sun, X., Chen, X., Yang, L., Huo, Y., Yang, J., Zhang, X., Han, H., Zhang, J., Li, G., Xiao, M., Guan, Y., Liu, M., Hu, J.*, Wang, L.*, Li, D.* (2023) Engineering of efficiency enhanced Cas9 and base editors with improved gene therapy efficacies. Mol. Ther.   31,  3.

8. Chen, X.#, Niu, X.#, Liu, Y.#, Zheng, R., Yang, L., Lu, J., Yin, S., Wei, Y., Pan, J., Sayed, A., Ma, X., Liu, M., Jiang, F., Liu, M., Hu, J.*, Wang, L.*, Li, D.* (2022). Long-term correction of hemophilia B through CRISPR/Cas9 induced homology-independent targeted integration. J. Genet. Genomics   49,  12.

9. Yin, J.#, Liu, M.#, Liu, Y.#, Wu, J., Gan, T., Zhang, W., Li, Y., Zhou, Y., Hu, J.* (2019). Optimizing genome editing strategy by primer-extension-mediated sequencing. Cell Discov.   5 ,18.

10. Liu, Y.#, Zhangding, Z.#, Liu, X., Hu, J.* (2025) Chromatin-centric insights into DNA replication. Trends   Genet .  41 , 412-424.