学院创建于1954年成立的北京医学院基础医学部，学科历史可追溯至1912年，1985年5月更名为北京医科大学基础医学院，2000年4月北京大学与北京医科大学合并后，更名为北京大学基础医学院。回顾70年的历程，我们感怀历代医学家、教育家的辛勤耕耘，感谢每一位为学院发展付出努力、做出贡献的师生员工和学院校友，70年奋斗历程中，我们得到国家“211计划”、“985工程”、“双一流”建设重点支持，成为中国医学领域领先的教学科研和人才培养基地，首轮“双一流”建设学科整体发展水平在“人才培养、科学研究、社会服务、总体情况”方面建设成效显著，为国家医学事业的发展做出了重要贡献。

学院以创新人才培养为核心使命，首创八年制基础医学专业，2019年入选国家级一流本科专业建设点，2020年入选教育部首批“强基计划”试点专业和“基础学科拔尖学生培养计划2.0基地”，形成了基础医学专业拔尖人才培养的优势特色，培养了大批医学科研和教学优秀人才。

学院坚持面向世界科技前沿和重大疾病防治需求，加强前沿科技平台及科技创新能力建设，拥有15个国家级和省部级重点实验室，6个二级学科进入ESI全球前1%或1‰学科。积极承担和完成国家重大重点科研项目任务，大力推进基于临床问题的基础研究和成果转化。在Science、Nature、Cell、NEJM等国际权威学术期刊发表一系列高水平论文，一批研究成果获得各类科技成果奖、发明专利、临床试验批文，在疾病机制、靶向药物、新型疫苗、细胞治疗、分子影像、诊断试剂等领域取得重要进展和突破。

21世纪人类面临肿瘤、心血管和代谢性疾病、神经系统疾病、传染病等重大疾病威胁以及人口老龄化等挑战；同时也迎来生命组学、基因编辑、生物治疗、智能医学为代表的新医学革命，高分辨、高通量、智能化的前沿技术驱动现代医学加速发展，基础研究到转化应用效率提高周期缩短。在新的征程上，挑战与机遇并存，我们将传承和发扬优良传统，深化改革，加强基础与临床学科交叉融合，践行70周年院庆主题“守正创新建设一流”，实现建设中国特色、世界一流基础医学院的目标。